Аникина Екатерина Владимировна начала свою профессиональную деятельность в Министерстве финансов Российской Федерации в 2006 году.

В течение 17 лет государственной гражданской службы в Минфине России основными задачами профессиональной деятельности Аникиной Е.В. являются проработка и анализ сложных юридических вопросов, возникающих в деятельности Минфина России, подготовка по ним правовых заключений, проведение комплаенс-контроля проектов актов и поручений Правительства Российской Федерации, антикоррупционной экспертизы проектов нормативных правовых актов, выявление и анализ проблемных случаев применения положений нормативных правовых актов, регулирующих отношения в бюджетной сфере.

Аникина Е.В. принимала непосредственное участие в работе по присоединению Российской Федерации к Конвенции ОЭСР по борьбе с подкупом иностранных должностных лиц при осуществлении международных коммерческих сделок от 21 ноября 1997 г. В результате данной работы принят Федеральный закон от 1 февраля 2012 г. № 3-ФЗ. В целях выполнения Российской Федерацией Конвенции ОЭСР по направлениям аудиторской деятельности, бухгалтерского учета и налогообложения Аникина Е.В. обеспечивала представление Минфина России в международных мероприятиях.

В связи с введением в Минфине России электронного документооборота Аникина Е.В. вела активную работу в подготовке новой редакции Инструкции по делопроизводству в Минфине России. В 2023 Аникина Е.В. разработала предложения для включения в Инструкцию в части урегулирования порядка подготовки и оформления международных договоров Российской Федерации в установленной сфере деятельности Минфина России.

Аникина Е.В. обеспечивала выполнение мероприятий Правового департамента по реализации Концепции открытости федеральных органов исполнительной власти.

При непосредственном участии Аникиной Е.В. осуществлялась разработка межведомственных нормативных правовых актов Минфина России в целях реализации Положения о работе с проектами, реализуемыми Российской Федерацией при участии международных финансовых организаций.

Аникина Е.В. внесла значительный вклад при разработке новой редакции учредительных документов Международного инвестиционного банка, принимала активное участие в реализации Российской Федерацией совместного со Всемирным банком проекта «Содействие повышению уровня финансовой грамотности и развитию финансового образования в Российской Федерации», обеспечивая разработку Минфином России международных договоров, гражданско-правовых договоров, контрактов по реализации проекта (подпроектов), по вопросам приобретения Минфином России исключительных прав правообладателей на результат интеллектуальной деятельности (произведения). Внесла значительный вклад при разработке и реализации Стратегии повышения финансовой грамотности в Российской Федерации на 2017-2023 годы. Аникиной Е.В. разработана форма соглашения с органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации о реализации Стратегии.

Аникина Е.В. принимала участие в разработке временного порядка исполнения перед резидентами и иностранными кредиторами государственных долговых обязательств Российской Федерации, выраженных в государственных ценных бумагах, номинальная стоимость которых указана в иностранной валюте.

В своей профессиональной деятельности Аникина Е.В. ведет активную работу по применению института наставничества и его развитию в Правовом департаменте.

За заслуги в области экономики и финансов, многолетнюю добросовестную работу Аникиной Е.В. объявлена благодарность Президента Российской Федерации, а также ее профессиональные заслуги неоднократно были отмечены Благодарностью Министра финансов Российской Федерации.